对那些认为高性能计算拥有革命性的访问和可用性的人来说——尤其是那些非技术性的研究人员，对于HPC是否适合公共云计算确实存在着很大的问题。大多数这种讨论总会由于性能出现的时候而到来，让我们面对它，对研究人员来说，大型的公共云计算比如Amazon的EC2并没有多少让人觉得很好的功能来满足一些的需求。当然按需使用性能是很好的，但是如果价格超过性能很多就不是很理想的事情了。

　　如果这就是我们在讨论的大型公共云计算，一个大多被用于科学计算和大型企业计算的形式，大概就类似于Amazon的EC2。当然，还有其他的一些公共云计算供应商，为了论证期间，亚马逊的弹性云计算所提供的往往是第一选择。从启动云供应商巨头，Amazon象征着每个人都进入云的可能性，它固有的问题集中体现在云概念中，尤其涉及到高性能计算时。

　　很难促进公共云向着某个特定的方向发展，因为现在标准的资源和应用已经足够成熟，而改变是要付出代价的。

　　一个德国的杂志《Computer Woche》的工作人员Dr.Dieter建议说，只有有权限的用户才能够使用公共云中的HPC。“有效利用云计算的方式取决于应用。云计算可以在线性过程时被充分应用，因为独立处理数据量较小。而对于更大的存储需求和紧密耦合以及高I/O并行应用时，云往往无用。”

　　早在2008年就有人研究这个问题，有关公共云中的性能差距，这当然被归结为MPI和互连问题，这个问题至今仍然没有解决。另外，虚拟化使得云几乎没有很多用于高性能计算的集群，换句话说，没有单纯的行为。

　　这种性能差距还体现在对分布式你存并行程序的MPI性能上，在单一计算节点OpenMP这种共享内存并行程序上也有表现，为什么EC2要改变风格以适应用户科学计算的需要呢？毕竟有其它的公司正取得高性能计算的一些进展，更好地调整方法来让研究人员使用自己的云，无论是什么形式，已经有所设计了。

　　现在，有越来越多云供应商的选择，消除虚拟化带来的性能差距已经造成用户对高性能计算驱动的需要。

　　IBM、微软、SGI等公司并不和他们的客户进行直接的在云中的交流，他们在其中也只是一部分作用，只能帮助传统的HPC用户进入到EC2中。他们意识到这个环境需定制，另外，性能是最关键的因素以吸引更多的回报。而且最重要的是，公共云打破了集群的能力，他们是租用专门为高性能计算用户设计的专门的集群。

　　很多HPC的用户发现，一些公司正在设计高性能计算云的概念，使之吸引HPC用户消除虚拟化的隐患，并提供定制的服务器。这种虚拟化层使用了一些并发的技术，这种技术可以避免投资失败，提高成本效益。

　　由于许多用户发现，大型公共云，比如说最典型的EC2并不提供服务水平，他们依赖的对象是合理的预测，NERSC的总监Kathy Yelick最近在接受采访时也表示过，现在肯定有一些HPC应用是适合云计算的，但是这并不是HPC的结束，一些串行的科学计算很适合云计算，但这绝对不是HPC的传统舞台。

　　有一些云供应商也可以很好地调整自己的方案以满足高性能计算应用程序对HPC明显的需求，显然对于HPC来说，云计算并非遥不可及。